Ok, lo standard attivo è ATA/ATAPI-6, UDMA MODE 5 (ULTRA ATA 100).

Sembra essere a posto, per sicurezza prova a seguire questa guida
http://club.cdfreaks.com/1712829-post5.html

Fatto, è tutto come indicato nella guida.

Allora il problema non è nel disco, non so che consigliarti se non una formattazione

Sicuramente c'è qualche conflitto software, sai qualche metodo per risolvere la questione?

Dovresti individuare e disinstallare il software che rallenta il pc, prova a pensare a qual'è stato l'ultimo sw che hai installato prima che iniziassero i rallentamenti.
Nel frattempo fai una pulizia del sistema con CCleaner

Ragazzi, devo dire però che ho misurato la velocità dell'hd primario e di un hd esterno della stessa capienza di quello principale, ebbene l'hd di sistema misura una velocità max di 2.8 Mb/s, mentre l'hd esterno misura 14.9 Mb/s. Può essere? Ho usato il programma HD Tune, quello che mi avete consigliato voi.

Non è affatto normale visto che funziona in ATA 100 (100MB/s), magari il disco è in fin di vita; apri hdtune e controlla la scheda "health"

L'hd l'ho comprato 4 mesi fa. Inoltre HD tune mi segnala tutti i parametri vitali OK.

Aggiorna i driver della scheda madre